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PHEONA:用于大型语言模型方法进行计算表型标记的评估框架

计算与语言 2025-07-08 v3

摘要

计算表型标记是医学研究中必不可少的任务,但通常需要大量时间和资源,尤其是因为传统方法通常涉及 Extensive 的手动数据审查。尽管机器学习和自然语言处理的进展有所帮助,但仍需进一步改进。鉴于大型语言模型(LLM)在基于文本的任务中已知的优势,仅有少数研究探索了将其用于这些任务。为促进该领域的进一步研究,我们开发了一个评估框架——观察健康数据表型标记评估(Evaluation of PHEnotyping for Observational Health Data, PHEONA),其概述了特定情境下的考虑因素。我们在概念分类——即急性呼吸失败(ARF)呼吸支持疗法的更广泛表型化过程中的一个具体任务——上应用并演示了 PHEONA。从测试的样本概念中,我们取得了高分类准确率,这表明基于 LLM 的方法有望改进计算表型化过程。

关键词

引用

@article{arxiv.2503.19265,
  title  = {PHEONA: An Evaluation Framework for Large Language Model-based Approaches to Computational Phenotyping},
  author = {Sarah Pungitore and Shashank Yadav and Vignesh Subbian},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2503.19265},
  year   = {2025}
}

备注

2 figures, 5 tables, accepted at 2025 AMIA Annual Symposium