相场晶体作为分子动力学的时间粗粒化
材料科学
2015-05-13 v3
摘要
相场晶体（PFC）是一种在原子尺度模拟材料的工具。它们结合了分子动力学（MD）的小长度尺度分辨率与在介观时间尺度模拟动力学的能力。我们展示了如何将 PFC 解释为对分子动力学模拟的微观密度场应用时间粗粒化的结果。我们从非均匀液体的经典密度泛函理论中获取相场的自由能形式，然后选择系数以匹配时间粗粒化微观密度场的结构因子。作为一个例子，我们展示了如何为 Weber 和 Stillinger 的二维方晶格势构建 PFC 自由能，该势模拟了悬浮在膜中的蛋白质系统。
引用
@article{arxiv.0707.1039,
title = {Phase Field Crystals as a Coarse-Graining in Time of Molecular Dynamics},
author = {P. F. Tupper and Martin Grant},
journal= {arXiv preprint arXiv:0707.1039},
year = {2015}
}
备注
5 pages, 4 figures, typos corrected, more explanation in parts, equilib vs non-equilib clarified