PDD 图：通过实体链接桥接电子病历与生物医学知识图谱
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2017-07-25 v2 人工智能
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摘要
电子病历包含多格式的电子医疗数据，其中蕴含丰富的医学知识。面对患者症状，经验丰富的照护者基于其准确掌握症状、诊断与相应治疗之间关系的专业知识做出正确医疗决策。本文旨在通过构建大规模高质量异质图，在电子病历（EMR）中关联患者、疾病和药物（PDD），以捕捉这些关系。具体而言，我们提出一种新颖框架，从 MIMIC-III（重症监护医学信息集市 III）中提取重要医学实体，并自动将其与现有生物医学知识图谱（包括 ICD-9 本体和 DrugBank）链接。本文所呈现的 PDD 图可通过 SPARQL 端点在网络上访问，并为医学发现与应用（如有效治疗推荐）提供路径。
引用
@article{arxiv.1707.05340,
title = {PDD Graph: Bridging Electronic Medical Records and Biomedical Knowledge Graphs via Entity Linking},
author = {Meng Wang and Jiaheng Zhang and Jun Liu and Wei Hu and Sen Wang and Xue Li and Wenqiang Liu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1707.05340},
year = {2017}
}
备注
9 pages,5 figures,accepted by ISWC 2017