直系同源：定义、推断及其对物种系统发育推断的影响
种群与进化
2019-03-13 v1
摘要
直系同源是进化基因组学与比较基因组学中的核心概念，用于关联不同物种中对应的基因。特别是，推断物种树需要直系同源基因。在本章中，我们介绍直系同源关系与直系同源组的基本概念，包括一些非平凡（因而常被误解）的推论。接下来，我们回顾用于识别直系同源基因的一些主要方法与资源。本章最后部分讨论了直系同源方法对物种系统发育推断的影响，并从若干近期比较研究中汲取经验教训。
引用
@article{arxiv.1903.04530,
title = {Orthology: definitions, inference, and impact on species phylogeny inference},
author = {Rosa Fernández and Toni Gabaldón and Christophe Dessimoz},
journal= {arXiv preprint arXiv:1903.04530},
year = {2019}
}
备注
To be published in book "Phylogenomics" (Nicolas Galtier, C\'eline Scornavacca, Fr\'ed\'eric Delsuc, Eds.)