提升植物研究数据 FAIR 性的本体方法
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2023-09-15 v1 人工智能
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摘要
提升研究数据的 FAIR 性（可发现性、可访问性、互操作性、可重用性）的重要性毋庸置疑，尤其是在组学技术当前产生的大型复杂数据集面前。促进数据集与其他类型数据的整合可增加其被重用的可能性，并提升回答新研究问题的潜力。本体是语义标注数据集的有用工具，因为添加相关元数据可增进对数据生成方式的理解并提高其互操作性。本体提供特定领域的概念以及概念间的关系。通过使用本体术语标注数据，数据变得既可供人类也可供机器解释，从而实现重用与互操作性的提升。然而，识别与特定研究领域或技术相关的本体是一项具有挑战性的任务，尤其是在基础植物研究这一多样化领域之中。在本综述中，我们概述了与基础植物科学最相关的本体，以及如何在 Investigation-Study-Assay (ISA) 等元数据框架内使用它们标注植物特异性实验相关数据。我们还概述了最有助于识别适用本体或查找本体术语的存储库与平台。
引用
@article{arxiv.2309.07129,
title = {Ontologies for increasing the FAIRness of plant research data},
author = {Kathryn Dumschott and Hannah Dörpholz and Marie-Angélique Laporte and Dominik Brilhaus and Andrea Schrader and Björn Usadel and Steffen Neumann and Elizabeth Arnaud and Angela Kranz},
journal= {arXiv preprint arXiv:2309.07129},
year = {2023}
}
备注
34 pages, 4 figures, 1 table, 1 supplementary table