mRNA 翻译的最佳下调
基因组学
2016-06-29 v2
摘要
mRNA 翻译的下调是生物医学各领域中的一个重要问题，涵盖从开发针对肿瘤和病毒疾病的有效药物，到开发可用于疫苗接种的减毒病毒株。在此，我们使用一种称为核糖体流模型（RFM）的数学模型来研究 mRNA 翻译下调的问题。在 RFM 中，mRNA 分子被建模为由 个位点组成的链。连续位点之间的核糖体流动由 个转移速率调节。给定一组模拟所有可能突变结果的可行转移速率，我们考虑通过在此可行速率集内改变速率来最大程度下调翻译速率的问题。在可行集的某些条件下，我们表明可以高效地确定最优解。我们还严格分析了下调优化问题的两个特例。我们的结果表明，必须关注 mRNA 分子上转移速率对蛋白质产率影响最强的位置。然而，该速率不一定是 mRNA 分子上最慢的转移速率。我们讨论了这些结果的一些生物学意义。
引用
@article{arxiv.1606.08094,
title = {Optimal Down Regulation of mRNA Translation},
author = {Yoram Zarai and Michael Margaliot and Tamir Tuller},
journal= {arXiv preprint arXiv:1606.08094},
year = {2016}
}