基于本体论的 COVID-19 表型注释与分析
其他定量生物学
2020-08-06 v1
摘要
COVID-19 的流行对世界各地不同地区的公共卫生造成了不可预测且破坏性的灾难。常见表型包括发热、咳嗽、呼吸短促和寒战。随着更多病例被调查,其他临床表型逐渐被认识,例如嗅觉丧失和味觉丧失。与出院或治愈患者相比,重症或死亡患者常有一项或多项合并症,如高血压、糖尿病和心血管疾病。在本研究中,我们系统收集并分析了来自 70 篇文章的 COVID-19 相关临床表型。将常见发生的 17 种表型基于人类表型本体论 (HPO) 分类为不同组。基于 HP 分类,我们系统分析了患者中识别出的三种神经表型(嗅觉丧失、味觉丧失和头痛)和四种腹部表型(恶心、呕吐、腹痛和腹泻),发现来自欧洲和美国的患者比亚洲患者倾向于具有更高的神经表型和腹部表型发生率。共发现 23 种合并症常见于 COVID-19 患者之中。患有这些合并症(如糖尿病和肾衰竭)的患者比无这些合并症的患者结局更差。
引用
@article{arxiv.2008.02241,
title = {Ontology-based annotation and analysis of COVID-19 phenotypes},
author = {Yang Wang and Fengwei Zhang and Hong Yu and Xianwei Ye and Yongqun He},
journal= {arXiv preprint arXiv:2008.02241},
year = {2020}
}