OncoScore：一种评估基因致癌潜力的新型互联网工具
基因组学
2017-04-11 v2 定量方法
摘要
癌症突变复杂且不断演变的图景，对从新一代测序（NGS）实验通常产生的大量突变列表中识别癌症基因构成了巨大挑战。因此，对这些变异进行优先级排序的能力至关重要。为解决这一问题，我们开发了 OncoScore，这是一种基于现有生物医学文献、根据基因与癌症的关联程度对其进行排名的文本挖掘工具。在人工整理的数据集上，受试者工作特征曲线及曲线下面积（AUC）指标证实了 OncoScore 出色的判别能力（OncoScore 截断阈值 = 21.09；AUC = 90.3%，95% 置信区间：88.1-92.5%），表明在需要高效地对癌症相关基因进行优先级排序的情况下，OncoScore 能提供有用的结果。
引用
@article{arxiv.1703.05692,
title = {OncoScore: a novel, Internet-based tool to assess the oncogenic potential of genes},
author = {Rocco Piazza and Daniele Ramazzotti and Roberta Spinelli and Alessandra Pirola and Luca De Sano and Pierangelo Ferrari and Vera Magistroni and Nicoletta Cordani and Nitesh Sharma and Carlo Gambacorti-Passerini},
journal= {arXiv preprint arXiv:1703.05692},
year = {2017}
}