带k处不匹配与少量无关字符的模式匹配
数据结构与算法
2016-10-31 v2
摘要
我们考虑带处不匹配的模式匹配问题,其中模式中可包含无关(通配)字符。具体而言,给定长度为的模式和长度为的文本,我们希望找到在中所有不匹配数不超过的出现位置。模式可包含无关字符,其能匹配任意字符。若无无关字符,解决带处不匹配模式匹配的最知名算法运行时间为。若模式中含有无关字符,最佳的确定性算法运行时间为 O(nk polylog m)。因此,有无无关字符的版本之间存在重要差距。本文中,我们给出一种运行时间随无关字符数量增加而增长的算法。我们定义{\em 岛}(island)为中不含无关字符的最大长度子串。设中岛的数量为。我们提出一种运行时间为的算法。若岛的数量为,该运行时间变为,这基本与无无关字符时带处不匹配模式匹配的最知名运行时间持平。若岛的数量为,该算法在渐近意义上快于先前带无关字符的处不匹配模式匹配最佳算法。
引用
@article{arxiv.1602.00621,
title = {On pattern matching with k mismatches and few don't cares},
author = {Marius Nicolae and Sanguthevar Rajasekaran},
journal= {arXiv preprint arXiv:1602.00621},
year = {2016}
}
备注
Information Processing Letters, Available online 27 October 2016, ISSN 0020-0190