OCTAVA：用于光学相干断层扫描血管成像图像定量分析的开源工具箱
图像与视频处理
2022-01-19 v1 计算机视觉与模式识别
组织与器官
摘要
光学相干断层扫描血管成像（OCTA）在研究与临床应用中，主要在眼科与皮肤科，对非侵入性地可视化与表征微血管进行。目前描述微血管使用了种类繁多的仪器、成像协议、处理方法与度量指标，以至于比较不同研究的结果尚不可行。为助力 OCTA 数据分析的标准化，我们报告了一个用户友好、开源的工具箱 OCTAVA（OCTA Vascular Analyzer），以标准化工作流自动化处理 en face OCTA 最大强度投影图像的预处理、分割与定量分析。我们呈现了每个分析步骤，包括滤波优化与分割算法选择，以及度量指标的定义。我们对来自不同商业与非商业仪器及样本中的 OCTA 图像进行定量分析，表明 OCTAVA 能准确且可重复地确定用于微血管表征的度量指标。广泛采用可促成规模足以开发可靠微血管生物标志物以早期检测并指导微血管疾病治疗的研究与数据聚合。
引用
@article{arxiv.2109.01835,
title = {OCTAVA: an open-source toolbox for quantitative analysis of optical coherence tomography angiography images},
author = {Gavrielle R. Untracht and Rolando Matos and Nikolaos Dikaios and Mariam Bapir and Abdullah K. Durrani and Teemapron Butsabong and Paola Campagnolo and David D. Sampson and Christian Heiss and Danuta M. Sampson},
journal= {arXiv preprint arXiv:2109.01835},
year = {2022}
}
备注
37 pages, 9 figures