低温下集光复合体II中存在小型相干子系统的数值证据
其他凝聚态物理
2008-12-09 v1 生物大分子
摘要
蛋白质-色素复合物中激子相干的程度对光合生物体的初始集光步骤具有重要意义。在这项工作中，我们用单激子哈密顿量对光系统II的主要天线蛋白，即集光复合体II（LHC-II）进行了建模，其中位点通过偶极-偶极相互作用耦合，并与耗散声子浴线性耦合。在适当的参数下，从 1 K 到 500 K 的激子相干长度的蒙特卡罗路径积分（MCPI）结果表明，在热力学平衡下，LHC-II 中的激子主要局域在2个单个叶绿素色素位点上，并在 A2-B2 对、A3-B3 对和 B1-B5-B6 三重态上保持持续的短程相干性。对上述子系统的准绝热路径积分（QUAPI）计算显示出向热力学平衡的平滑、非相干弛豫。所得结果表明，除了低温下的小型相干子系统外，LHC-II 中的激子比紫细菌 Rs. molischianum 的类似集光复合体II（LH-II）中的激子更加局域化，这可以由前者的较低对称性预期。
引用
@article{arxiv.0812.1552,
title = {Numerical Evidence of Small Coherent Subsystems at Low Temperatures in Light Harvesting Complex II},
author = {Jiahao Chen and Nancy Makri},
journal= {arXiv preprint arXiv:0812.1552},
year = {2008}
}
备注
28 pages, 5 figures, summary of JC's BSc thesis