NOTMAD:估计具有样本特定结构与参数的贝叶斯网络
机器学习
2021-11-02 v1 人工智能
机器学习
摘要
情境特定的贝叶斯网络(即有向无环图,DAGs)可识别变量间依赖于情境的关系,但由无环性要求引发的非凸性使得在情境特定的估计量之间(例如借助图生成函数)共享信息变得困难。为此,现有推断情境特定贝叶斯网络的方法倾向于将数据集拆分为子样本,这限制了统计功效与分辨率,并妨碍了多维与潜在情境的使用。为克服这一挑战,我们提出NOTEARS优化的原型DAG混合模型(NOTMAD)。NOTMAD将情境特定的贝叶斯网络建模为一个函数的输出,该函数学习依据样本情境混合原型网络。原型网络与情境特定网络联合估计,且不需要任何先验知识。我们将无环性约束编码为一个平滑正则化损失,并将其反向传播至混合函数;借此,NOTMAD在情境特定的无环图之间共享信息,从而能够在甚至单样本分辨率下估计贝叶斯网络的结构与参数。我们通过分析与实验展示了NOTMAD及样本特定网络推断的效用,包括对应于癌症中形态变异的患者特定基因表达网络。
引用
@article{arxiv.2111.01104,
title = {NOTMAD: Estimating Bayesian Networks with Sample-Specific Structures and Parameters},
author = {Ben Lengerich and Caleb Ellington and Bryon Aragam and Eric P. Xing and Manolis Kellis},
journal= {arXiv preprint arXiv:2111.01104},
year = {2021}
}