无驱动的高分子穿移纳米孔：逃逸与弛豫过程耦合的计算证据
生物大分子
2009-11-13 v1
摘要
大多数描述高分子链穿过纳米孔的理论模型都使用这样一个假设：高分子在整个过程中始终处于弛豫状态。换言之，模型通常假设链的特征弛豫时间与穿移时间相比足够小，以至于非平衡分子构象可以被忽略。在本文中，我们使用分子动力学模拟，通过观察具有不同初始条件的无偏高分子链的逃逸时间来直接检验这一假设。我们发现，对于所研究的系统，穿移过程并未完全处于平衡态，尽管穿移时间 大约是弛豫时间 的10倍。我们最显著的结果是观察到链的后半部分在不到总逃逸时间~12%的时间内逃逸，这意味着链在从通道逃逸的末端存在巨大的加速。
引用
@article{arxiv.0811.1005,
title = {Non-driven polymer translocation through a nanopore: computational evidence that the escape and relaxation processes are coupled},
author = {Michel G. Gauthier and Gary W. Slater},
journal= {arXiv preprint arXiv:0811.1005},
year = {2009}
}