符号序列的模体网络
分子网络
2010-10-27 v2 数据分析、统计与概率
物理与社会
基因组学
摘要
我们引入了一种方法，将符号序列的集合转换为加权有向网络，其中节点为模体，有向链接及其权重由两个模体在同一序列中具有统计显著性的共现定义。对模体网络社群的分析表明，该方法能够将人类蛋白质组数据库中的序列与功能相关联，检测在线社交对话中的热门话题，刻画动力系统的轨迹，并可能在其他领域中找到处理大量数据的有用应用。
引用
@article{arxiv.1002.0668,
title = {Networks of motifs from sequences of symbols},
author = {Roberta Sinatra and Daniele Condorelli and Vito Latora},
journal= {arXiv preprint arXiv:1002.0668},
year = {2010}
}
备注
Accepted for publication in Phys. Rev. Lett. Main article 4 pages, 2 figure; supplementary material 4 pages, 1 figure