利用DNA条形码进行网络克隆
神经元与认知
2016-11-04 v1
摘要
测量或操控网络连接的能力是连接组学领域的主要挑战。最近，一组方法利用下一代DNA测序来扫描神经元之间的连接，将其转化为一组DNA条形码。称为标记（markers）的单个DNA序列代表单个神经元，而称为条形码（barcodes）的标记对包含关于连接的信息。在这里，我们提出了一种策略，将条形码中包含的连接性"复制"或"克隆"到一个干净的白板（tabula rasa）网络中。我们表明，一标记一细胞（OMOC）规则——强制所有具有相同序列的标记凝聚到同一个神经元中——能够在新网络中快速且可靠地形成期望的连接性。我们表明OMOC规则在由网络规模的幂律函数给出的步数内收敛。因此，我们提出从一个网络复制网络连接到另一个网络在理论上是可能的。
引用
@article{arxiv.1611.00834,
title = {Network cloning using DNA barcodes},
author = {Sergey A. Shuvaev and Batuhan Başerdem and Anthony Zador and Alexei A. Koulakov},
journal= {arXiv preprint arXiv:1611.00834},
year = {2016}
}
备注
5 pages, 3 figures