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图上空间结构种群中的突变体命运:连接模型与实验

种群与进化 2024-12-30 v2 定量方法

摘要

在自然界中,大多数微生物种群具有复杂的空间结构,这会影响它们的进化。进化图论预测,通过将个体置于图的节点上建模的某些空间结构会影响突变体固定的概率。进化实验正开始明确探讨图结构对突变体固定的影响。然而,进化图论的假设与现代进化实验的条件不同,使得理论与实验之间的比较具有挑战性。在这里,我们旨在通过使用我们新的空间结构种群模型来弥合这一差距。该模型考虑了位于图节点上的相连子种群,并允许非对称迁移。它可以处理大种群,并明确模拟带有迁移的连续传代事件,从而紧密模仿实验条件。我们根据该模型分析了最近的实验。我们为未来的实验建议了有用的参数区间,并对这些实验做出了定量预测。特别是,我们提出了一些实验来直接测试我们最近的预测,即与充分混合的种群相比,具有非对称迁移的星形图会抑制自然选择,并能加速突变体的固定或灭绝。

关键词

引用

@article{arxiv.2402.03967,
  title  = {Mutant fate in spatially structured populations on graphs: connecting models to experiments},
  author = {Alia Abbara and Lisa Pagani and Celia García-Pareja and Anne-Florence Bitbol},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2402.03967},
  year   = {2024}
}

备注

Main text: 15 pages, 5 figures. 7 supplementary figures