从子串的多链重建
信息论
2022-05-11 v1 math.IT
摘要
基于子串谱的字符串重建问题由于其在DNA数据存储与测序中的适用性,近来受到显著关注。与以往工作不同,我们在本文中考虑该问题的一个设定,其中多个字符串被一同重建。给定字符串的多重集,其所有长度为某固定值的子串(定义为的-剖面)被接收,目标是重建中的所有字符串。多链-重建码是一组多重集,使得每个元素可由其-剖面重建。给定字符串数~及其长度~,我们首先找到对于具有非零渐近码率的多链-重建码存在所必需的值的下界。随后我们给出此类码的两个构造,并证明对于渐近行为如该下界的值,其码率趋近于~。
引用
@article{arxiv.2108.11725,
title = {Multi-strand Reconstruction from Substrings},
author = {Yonatan Yehezkeally and Sagi Marcovich and Eitan Yaakobi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2108.11725},
year = {2022}
}
备注
5 pages + 1 reference page. Version accepted for presentation at ITW2021