mRNA扩散解释果蝇早期发育中的蛋白质梯度
定量方法
2009-09-24 v1 分子网络
摘要
我们提出了一个新模型，用于描述果蝇胚胎前后轴上Bicoid蛋白质稳定梯度的产生和建立。在该模型中，我们考虑bicoid mRNA沿胚胎前后轴扩散，而蛋白质在位于合胞体核附近的核糖体中产生。Bicoid蛋白质如实验观察所示，停留在合胞体核附近。我们利用果蝇发育胚胎卵裂期11至14阶段的实验数据校准了数学模型的参数。实验梯度与模型梯度之间吻合良好，相对误差在5-8%范围内。推断出的bicoid mRNA扩散系数在4.6×10^{-12}-1.5×10^{-11}m^2s^{-1}范围内，与细胞质中大分子扩散的理论预测和实验测量结果一致。我们表明，基于mRNA扩散假设的模型与已知观测数据一致，支持了近期关于果蝇中bicoid mRNA梯度的实验发现[Spirov et al. (2009) Development 136:605-614]。
引用
@article{arxiv.0909.4239,
title = {mRNA diffusion explains protein gradients in \textit{Drosophila} early development},
author = {Rui Dilão and Daniele Muraro},
journal= {arXiv preprint arXiv:0909.4239},
year = {2009}
}
备注
14 pages, 2 figures