MPAgenomics：用于基因组标记多患者分析的 R 包
定量方法
2014-01-21 v1 应用统计
摘要
MPAgenomics 代表基因组标记的多患者分析（MPA），是一个 R 包，致力于：（i）高效分割，以及（ii）从多患者拷贝数和 SNP 数据谱中进行基因组标记选择。它提供了常用软件包的封装，以促进其重复性（有时是困难的）使用，为 R 的初学者提供了一条易于使用的流程。对连续多个谱（寻找丢失和增益）的分割基于对有影响参数的一种新的自动选择，因为原始包中的默认参数具有误导性。同时考虑多个谱时，MPAgenomics 封装了高效的惩罚回归方法，以选择与给定响应相关的有效标记。
引用
@article{arxiv.1401.5035,
title = {MPAgenomics : An R package for multi-patients analysis of genomic markers},
author = {Quentin Grimonprez and Alain Celisse and Meyling Cheok and Martin Figeac and Guillemette Marot},
journal= {arXiv preprint arXiv:1401.5035},
year = {2014}
}