基于粗粒化单点手性势的手性棒簇形态分析
软凝聚态物质
2019-10-02 v1 化学物理
计算物理
摘要
我们提出了一种用于模拟手性相互作用的粗粒化单点势，其强度、手性和偏好扭转角均可调节。作为一个应用，我们执行 basin-hopping 全局优化以预测手性棒簇的偏好几何结构。基于这些预测的形态相图包含四个不同的族，包括先前报道的基于形状引入手性的势的结构，如膜和螺旋。这两种构型之间的转变重现了 {\it{fd}} 噬菌体实验结果的一些关键特征。该势计算代价低、直观且通用；我们期望它将对大规模手性分子模拟有用。对于限制在圆柱形容器中的手性粒子，我们重现了瓶中 fusilli 意面所观察到的行为。因此，该 chiropole 势能够提供从宏观到分子长度尺度结构的洞察。
引用
@article{arxiv.1910.00378,
title = {Morphological analysis of chiral rod clusters from a coarse-grained single-site chiral potential},
author = {B. J. Sutherland and S. W. Olesen and H. Kusumaatmaja and J. W. R. Morgan and D. J. Wales},
journal= {arXiv preprint arXiv:1910.00378},
year = {2019}
}
备注
7 figures, accepted in Soft Matter