RNA-LEGO：假结 RNA 的组合设计

在本文中，我们枚举了具有给定最小堆叠长度的 k-非交叉 RNA 假结结构。我们证明，不含孤立碱基对的 k-非交叉结构数量显著小于所有 k-非交叉结构的数量。特别地，我们证明堆叠长度 ≥ 2 的 3-非交叉和 4-非交叉 RNA 结构在 n 很大时分别为 $311.2470 \frac{4!}{n(n-1)...(n-4)}2.5881^n$ 和 $1.217\cdot 10^{7} n^{-{21/2}} 3.0382^n$。我们进一步证明，对于 k-非交叉 RNA 结构，所有结构数量与所有堆叠大小 ≥ 2 的结构数量之间指数增长率的下降显著增加。我们的结果对假结 RNA 预测算法具有重要意义，并为假结 RNA 结构的中性网络提供了证据。