脂质与肽之间疏水错配的分子理论
软凝聚态物质
2009-11-07 v1 统计力学
生物物理
q-bio
摘要
我们利用脂质的微观模型来研究脂质与可 integral 蛋白的 α 螺旋结构跨膜疏水长度 d 与膜疏水厚度 D_h 之间的错配效应。特别是，我们考察了刚性、integral 蛋白的疏水长度和体积分数对 lamellar 相周期的依赖。我们发现，当插入短肽（即 d<D_h 时），周期会减小。更令人惊讶的是，我们发现当插入长肽（即 d>D_h 时），周期会增加。这种效应是由于用刚性肽取代可伸缩的脂质尾部所致。随着肽长度的增加， lamellar 周期继续增加，但增长率减慢，最终可以减小。疏水错配程度 |d-D_h| 越大，未能在膜中穿通并跨膜的肽的量就越大。我们阐明了这些行为——所有这些现象都与实验结果一致。对单根跨膜 α 螺旋的倾斜度随疏水错配和螺旋密度的依赖作出了预测。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0108237,
title = {Molecular theory of hydrophobic mismatch between lipids and peptides},
author = {Daniel Duque and Xiao-jun Li and Kirill Katsov and Michael Schick},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0108237},
year = {2009}
}
备注
14 pages, 5 figures