开放系统的分子动力学：平均场粒子库的构建
计算物理
2019-04-26 v1 介观与纳米尺度物理
软凝聚态物质
统计力学
化学物理
摘要
开放分子系统的模拟需要显式或隐式的能量和粒子库。虽然感兴趣区域需要全原子分辨率，但库的实现有一定的自由度。在这里，我们通过将原子区域与嵌入热力学平均场中的点状非相互作用粒子（示踪剂）区域连接，构建了一个组合的显式库。示踪分子在进入原子区域时获得原子分辨率并与该环境平衡，而原子分子在穿过原子边界后成为由有效平均场势支配的示踪剂。该方法在液态水的热力学、结构和动力学性质上进行了广泛测试。突出并讨论了该过程的概念和数值优势以及新的前景。
引用
@article{arxiv.1902.07067,
title = {Molecular dynamics of open systems: construction of a mean-field particle reservoir},
author = {Luigi Delle Site and Christian Krekeler and John Whittaker and Animesh Agarwal and Rupert Klein and Felix Höfling},
journal= {arXiv preprint arXiv:1902.07067},
year = {2019}
}
备注
accepted as communication in Advanced Theory and Simulations