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带电球体诱导的纳米孔电流调制:对 DNA 对接的启示

生物物理 2015-07-22 v1 软凝聚态物质 生物大分子

摘要

DNA 通过纳米孔的过程可有效分解为两个不同阶段:对接和实际易位。实验中,每个阶段由独特的电流特征表征,从而能够区分这两个事件。然而,在低电压下,两个阶段的清晰区分会丢失。通过数值模拟,我们阐明了与对接事件相关的电流特征如何依赖于外加电压。模拟表明,在小电压下,DNA 球体由于电荷载流子的富集而增强了孔的电导。在高电压下,球体从孔区域抽取大量电荷载流子,从而降低了整体电导。这些结果为电导实验数据提供了新的解释,并展示了对接如何干扰易位信号,这对测序应用具有潜在意义。

关键词

引用

@article{arxiv.1507.05758,
  title  = {Modulation of current through a nanopore induced by a charged globule: implications for DNA-docking},
  author = {Mauro Chinappi and Carlo Massimo Casciola and Fabio Cecconi and Umberto Marini Bettolo Marconi and Simone Melchionna},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1507.05758},
  year   = {2015}
}

备注

6 pages, 5 figures