用于 ab initio 电子结构计算的最小参数隐式溶剂模型
计算物理
2011-12-07 v1 化学物理
摘要
我们提出了一种用于 ab initio 电子结构计算的隐式溶剂模型,该模型完全自洽,并基于非均匀泊松方程的直接求解。溶质空腔根据 Fattebert 和 Gygi (J. Comp. Chem. 23, 6 (2002)) 的公式,以电子密度的等值面自然定义。尽管该模型仅依赖于两个参数,但我们证明,通过使用适当的边界条件和色散-排斥贡献,对于包含中性和带电分子的大量测试集所获得的溶剂化能相较于现有模型有显著改善。我们的方法实现于(但不限于)线性标度密度泛函理论 (DFT) 框架中,为在前所未有的大规模系统上进行自洽隐式溶剂 DFT 计算开辟了道路,我们通过对一个 2615 原子的蛋白质-配体复合物的计算对此进行了演示。
引用
@article{arxiv.1112.1268,
title = {Minimal parameter implicit solvent model for ab initio electronic structure calculations},
author = {Jacek Dziedzic and Hatem H. Helal and Chris-Kriton Skylaris and Arash A. Mostofi and Mike C. Payne},
journal= {arXiv preprint arXiv:1112.1268},
year = {2011}
}
备注
Europhys Lett., 95 (2011)