蛋白质凝胶中标记点与未标记构型的匹配
应用统计
2012-09-28 v1
摘要
未标记形状分析是统计学中一个迅速兴起且充满挑战的领域，这由生物信息学中的各种新颖应用所驱动。本文考虑在多种约束下匹配两个构型的情形，即构型包含一个手动定位的“标记点”子集（彼此匹配的概率很高），而较大的子集由未标记点组成。我们提出了一个合理的模型，并给出了使用 EM 算法的实现方案。这项工作受肾癌凝胶真实实验的启发，我们的方法允许标记点缺失或错误分配的可能性。该方法已成功用于在给定数据集中自动定位并移除一个严重错误分配的标记点。
引用
@article{arxiv.1209.6167,
title = {Matching markers and unlabeled configurations in protein gels},
author = {Kanti V. Mardia and Emma M. Petty and Charles C. Taylor},
journal= {arXiv preprint arXiv:1209.6167},
year = {2012}
}
备注
Published in at http://dx.doi.org/10.1214/12-AOAS544 the Annals of Applied Statistics (http://www.imstat.org/aoas/) by the Institute of Mathematical Statistics (http://www.imstat.org)