利用条件互信息的参数显著性检验进行马尔可夫链阶数估计
统计方法学
2015-11-10 v1 信息论
math.IT
数据分析、统计与概率
摘要
尽管文献中提出了不同方法,从给定符号序列精确估计马尔可夫链的阶数仍是一个开放问题,尤其当阶数中等偏大时。本文对符号序列上递增阶数 的条件互信息(CMI) 进行参数显著性检验,以估计底层马尔可夫链的真实阶数 。阶数为 的 CMI 是马尔可夫链中相隔 个时间步的两个变量在以链的中间变量为条件下的互信息。CMI 的零分布用正态分布和伽马分布近似,推导出其参数的解析表达式,并用从正态分布的均值和方差导出参数的伽马分布近似。使用三种参数检验评估阶数估计的准确性,并利用具有不同阶数 、符号序列长度 和符号数 的马尔可夫链的 Monte Carlo 模拟,将参数检验与随机化显著性检验及其他已知阶数估计准则进行比较。使用伽马分布(参数直接定义)的参数检验始终优于其他两种参数检验,且与随机化检验的性能匹配良好。将检验应用于 DNA 序列的基因和基因间区,并根据模拟研究的结果解释所估计的阶数。该应用表明,对于随机化检验计算变得极其缓慢的长符号序列,参数伽马检验具有实用价值。
引用
@article{arxiv.1511.02339,
title = {Markov chain order estimation with parametric significance tests of conditional mutual information},
author = {Maria Papapetrou and Dimitris Kugiumtzis},
journal= {arXiv preprint arXiv:1511.02339},
year = {2015}
}
备注
19 pages, 7 figures