LYSTO：淋巴细胞评估黑客松与基准数据集
图像与视频处理
2023-04-14 v2 计算机视觉与模式识别
摘要
我们介绍 LYSTO，即淋巴细胞评估黑客松，该活动与 2019 年 MICCAI 会议在中国深圳联合举办。竞赛要求参与者在经 CD3 与 CD8 免疫组化染色的结肠、乳腺和前列腺癌组织病理图像中自动评估淋巴细胞（特别是 T 细胞）数量。不同于医学图像分析中设立的其他挑战赛，LYSTO 参与者仅有数小时来解决此问题。本文中，我们描述黑客松的目标与多阶段组织方式；我们描述所提出的方法与现场结果。此外，我们给出赛后结果，展示所提方法在一组独立的肺癌切片（非初始竞赛部分）上的表现，以及所提方法与一组病理学家在淋巴细胞评估上的比较。我们显示部分参与者能够达到病理学家水平的淋巴细胞评估性能。黑客松结束后，LYSTO 作为一个轻量级即插即用基准数据集留在 grand-challenge 网站上，并配有自动评估平台。LYSTO 已支持肿瘤学中多项淋巴细胞评估研究。LYSTO 将成为深度学习与数字病理学的长期教育性挑战，其地址为 https://lysto.grand-challenge.org/。
引用
@article{arxiv.2301.06304,
title = {LYSTO: The Lymphocyte Assessment Hackathon and Benchmark Dataset},
author = {Yiping Jiao and Jeroen van der Laak and Shadi Albarqouni and Zhang Li and Tao Tan and Abhir Bhalerao and Jiabo Ma and Jiamei Sun and Johnathan Pocock and Josien P. W. Pluim and Navid Alemi Koohbanani and Raja Muhammad Saad Bashir and Shan E Ahmed Raza and Sibo Liu and Simon Graham and Suzanne Wetstein and Syed Ali Khurram and Thomas Watson and Nasir Rajpoot and Mitko Veta and Francesco Ciompi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2301.06304},
year = {2023}
}
备注
will be sumitted to IEEE-JBHI