TNF 诱导的细胞凋亡模型与 HeLa 细胞定量蛋白质组学数据的整合——我们的初步经验
分子网络
2013-01-16 v1
摘要
使用我们的整合计算模型，结合在 HeLa 细胞系上获得的最新定量蛋白质组学数据，对 TNF 启动的过程进行了模拟。尽管模型开发基于有限的实验信息，且缺失数据由模拟估计以及使用不同细胞系的间接实验进行参数化，但结合 HeLa 实验数据的实际模型在计算预测行为与实验之间表现出了良好的一致性。由于未观察到与实验确定的 HeLa 细胞功能有显著偏离，这可被视为一个令人鼓舞的迹象，表明该细胞系行为的主要特征被正确重现，并指示了针对特定细胞系的计算实验的新可能性。
引用
@article{arxiv.1301.3318,
title = {Integration of TNF induced apoptosis model and quantitative proteomics data of HeLa cells - our first experience},
author = {Csilla Ulicna and Jozef Ulicny},
journal= {arXiv preprint arXiv:1301.3318},
year = {2013}
}