利用分子流行病学数据推断结核分枝杆菌多重耐药的获得

我们利用来自玻利维亚的分子流行病学数据，研究自然人群中药物耐药性获得的速率。首先，我们研究患者体内从双敏感状态直接获得双耐药的速率，并将其与演化为单耐药的速率进行比较。具体而言，我们探讨双耐药是否能在给定宿主体内由双敏感状态直接演化而来。其次，我们旨在理解利福平与异烟肼耐药突变率的差异是否体现在流行病学尺度上。第三，我们估算耐多药结核（MDR TB）病例中由 MDR 菌株传播所致的比例，以及与通过演化获得耐药的比例。为解决这些问题，我们建立了结核病传播模型，其中追踪对两种药物耐药性的演化及 VNTR 位点的演化。然而，现有数据不完整，仅记录了{部分人群且}在单一时间点。所提模型诱导的似然函数在计算上难以评估，因此无法直接处理。为此，我们采用近似贝叶斯计算技术进行统计推断。