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输入涨落如何重塑生物开关系统的动力学

分子网络 2015-06-11 v1 生物物理 定量方法

摘要

定量生物学的一项重要任务是理解随机性在生化调控中的作用。作为我们近期工作 [Phys. Rev. Lett. 107, 148101 (2011)] 的扩展,本文研究了输入涨落如何影响简单生物开关的随机动力学。在我们的模型中,开关的开启跃迁速率直接受噪声输入信号调控,该信号被描述为非负均值回归扩散过程。这一连续过程可以很好地近似离散的生灭过程,且在解析上更易处理。在此新框架下,我们应用 Feynman-Kac 定理研究了输出开关动力学的统计特征。与我们之前的发现一致,输入噪声被发现能有效抑制依赖于输入的跃迁。我们通过解析证明,当输入信号的振幅大幅波动且缓慢回归其均值时,这种效应变得显著。

关键词

引用

@article{arxiv.1210.4616,
  title  = {How input fluctuations reshape the dynamics of a biological switching system},
  author = {Bo Hu and David A. Kessler and Wouter-Jan Rappel and Herbert Levine},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1210.4616},
  year   = {2015}
}

备注

7 pages, 4 figures, submitted to Physical Review E