蛋白质如何搜索其在 DNA 上的特定位点：片段间转移的作用
生物大分子
2011-11-10 v1 软凝聚态物质
摘要
众所周知，蛋白质在 DNA 上定位其特定靶点的速度比 Smoluchowski 三维扩散速率的预测值快达两个数量级。为解决这一差异而提出的机制之一被称为“片段间转移”（intersegment transfer）。许多蛋白质拥有两个 DNA 结合位点，无需解离到水中即可从一个 DNA 片段转移到另一个片段。我们计算了此类蛋白质在致密球状 DNA 中的靶点搜索速率，同时考虑了与 DNA 运动及蛋白质沿 DNA 滑动协同作用的片段间转移。研究表明，在蛋白质大部分时间吸附于 DNA 的情况下，片段间转移起着非常重要的作用。
引用
@article{arxiv.0707.3606,
title = {How a protein searches for its specific site on DNA: the role of intersegment transfer},
author = {Tao Hu and B. I. Shklovskii},
journal= {arXiv preprint arXiv:0707.3606},
year = {2011}
}
备注
9 pages, 7 figures