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多微生物感染中生态相互作用的宿主间变异

种群与进化 2015-06-19 v1 统计力学

摘要

在感染和稳态过程中,常观察到微生物与多细胞宿主之间相互作用的宿主间变异性。然而,用于分析宿主 - 微生物关系的大多数机制模型,以及为解释宿主与微生物共同进化而提出的大多数生态理论,均基于宿主群体的平均值。通过假设观测到的变异是随机且独立的,这些模型忽略了宿主间差异的作用。在此,我们利用龙猫中多微生物性中耳炎 (OM) 这一特征明确的实验感染模型,结合种群动力学模型和基于最大熵 (MaxEnt) 的推断方案,分析了宿主间变异背后的机制。我们发现,细菌物种间相互作用的性质 critically 调节了这些相互作用的宿主间变异。令人惊讶的是,看似无关的现象,如单个细菌物种利用营养物质生长的效率以及微生物特异性的宿主免疫反应,在宿主群体中可能变得相互依赖。后一发现表明,在宿主免疫反应与细菌物种的共同进化过程中,可能存在一种导致特定细菌物种菌株被选择的潜在机制。

关键词

引用

@article{arxiv.1404.6668,
  title  = {Host-to-host variation of ecological interactions in polymicrobial infections},
  author = {Sayak Mukherjee and Kristin E. Weimer and Sang-Cheol Seok and Will C. Ray and C. Jayaprakash and Veronica J. Vieland and W. Edward Swords and Jayajit Das},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1404.6668},
  year   = {2015}
}

备注

39 Pages 6 figures