HOOMD-blue：用于高性能分子动力学和硬粒子蒙特卡洛模拟的 Python 包
计算物理
2019-10-21 v2
摘要
HOOMD-blue 是一个粒子模拟引擎，专为纳米和胶体尺度的分子动力学及硬粒子蒙特卡洛模拟而设计。自 2007 年 3 月以来一直在积极开发，并自 2008 年 8 月起开源。HOOMD-blue 是一个 Python 包，拥有我们从零开始构建的用于 GPU 加速的高性能 C++/CUDA 后端。Python 接口允许用户将 HOOMD-blue 与 Python 生态系统中的其他包结合，以创建模拟和分析工作流。我们采用软件工程实践来开发、测试、维护和扩展代码。
引用
@article{arxiv.1308.5587,
title = {HOOMD-blue: A Python package for high-performance molecular dynamics and hard particle Monte Carlo simulations},
author = {Joshua A. Anderson and Jens Glaser and Sharon C. Glotzer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1308.5587},
year = {2019}
}
备注
Major revisions