利用流形优化与纠错机制的单倍型组装
最优化与控制
2019-04-16 v2 信号处理
摘要
近期基于矩阵补全的方法未能对含噪观测下的单倍型组装问题（HAP）进行恰当建模。为应对此情形，本文提出一种基于最小纠错（MEC）的、在秩一矩阵流形上的矩阵补全优化问题。我们证明了求解该问题的特定迭代算法的收敛性。仿真结果表明，所提方法不仅优于一些知名的基于矩阵补全的方法，而且相比最新的基于 MEC 的单倍型估计算法给出了更精确的结果。
引用
@article{arxiv.1901.00136,
title = {Haplotype Assembly Using Manifold Optimization and Error Correction Mechanism},
author = {Mohamad Mahdi Mohades and Sina Majidian and Mohammad Hossein Kahaei},
journal= {arXiv preprint arXiv:1901.00136},
year = {2019}
}