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GUBS:一种面向合成生物学的开放系统基于行为的语言

编程语言 2012-11-20 v2 计算工程、金融与科学

摘要

在本文中,我们提出了一种领域特定语言 GUBS(Genomic Unified Behavior Specification,基因组统一行为规范),专用于合成生物器件的行为规范,将其视为离散开放动力系统。GUBS 是一种基于规则的声明式语言。与封闭系统不同,程序始终只是系统行为的部分描述。该语言的语义考虑了某些隐藏的未指定动作的存在,这些动作可能会改变编程器件的行为。其编译框架遵循类似于自动定理证明的方案,旨在提高合成生物设计的安全性。

关键词

引用

@article{arxiv.1206.6098,
  title  = {GUBS, a Behavior-based Language for Open System Dedicated to Synthetic Biology},
  author = {Adrien Basso-Blandin and Franck Delaplace},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1206.6098},
  year   = {2012}
}

备注

In Proceedings MeCBIC 2012, arXiv:1211.3476