Graphettes:图元与轨道身份的常数时间判定,包含规模至 8 的(可能非连通)图元
数据结构与算法
2017-08-16 v1 分子网络
定量方法
摘要
图元是较大图 的小连通导出子图。目前图元常被用于量化网络领域中的局部与全局拓扑。现有方法利用轨道计数方程,尽可能高效地穷举大型网络中的所有图元(及其轨道)。然而, 中图元的数量在 的节点数和边数上均呈指数增长。在现有大型网络上枚举所有图元的代价已不可接受,且随着网络规模和密度的持续增长,该问题将愈发严重。在此,我们引入一种高效方法,旨在辅助从大型网络中对规模至 的图元进行统计采样。我们将 graphettes 定义为允许非连通图元的图元推广。给定一个特定的(无向)graphette ,我们引入规范 graphette 的概念,作为 的同构群 的一个代表元。我们以查找表的形式计算了从所有规模为 的 个无向 graphettes 到其规范代表元 的映射 ,以及将 转换为 的置换。我们还计算了每个规范 graphette 的所有自同构轨道。因此,给定图 中任意 个节点,我们可以在常数时间内推断出其所属的 graphette,以及这 个节点各自所属的轨道。对大量 个此类 节点集进行采样,可以近似得到 中图元与轨道的分布,以及每个节点的轨道度向量。
关键词
引用
@article{arxiv.1708.04341,
title = {Graphettes: Constant-time determination of graphlet and orbit identity including (possibly disconnected) graphlets up to size 8},
author = {Adib Hassan and Po-Chien Chung and Wayne B. Hayes},
journal= {arXiv preprint arXiv:1708.04341},
year = {2017}
}
备注
13 pages, 4 figures, 2 tables. Accepted to PLOS ONE