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GNNFormer:一种基于图的细胞病理学报告生成框架

计算机视觉与模式识别 2023-03-20 v1 人工智能

摘要

细胞病理学报告生成是病理图像标准化检查的必需步骤。然而,手动撰写详细报告给病理医生带来沉重工作负担。为提高效率,一些已有工作研究了细胞病理学报告的自动生成,主要是应用为自然图像提出的视觉编码器之上的图像描述生成框架。这些工作的一个共同弱点在于未显式建模细胞间的结构信息,而这是病理图像的关键特征并为诊断提供重要信息。在本文中,我们提出一种称为 GNNFormer 的新型基于图的框架,将图神经网络(GNN)与 Transformer 无缝集成于同一框架中,用于细胞病理学报告生成。据我们所知,GNNFormer 是首个显式建模病理图像中细胞间结构信息的报告生成方法。它还有效融合细胞间结构信息、细胞的细粒度形态特征和背景特征以生成高质量报告。在 NMI-WSI 数据集上的实验结果表明,GNNFormer 可以优于其他最先进的基线方法。

关键词

引用

@article{arxiv.2303.09956,
  title  = {GNNFormer: A Graph-based Framework for Cytopathology Report Generation},
  author = {Yang-Fan Zhou and Kai-Lang Yao and Wu-Jun Li},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2303.09956},
  year   = {2023}
}

备注

12 pages, 6 figures