基于几何本征子空间框架的分子构象表示用于高效结构识别与比较
材料科学
2017-05-24 v2 化学物理
摘要
我们开发了一种扩展距离矩阵方法，通过谱分解研究分子几何构型。结果表明，本征空间中所有原子的位置均可由其本征坐标精确指定，而本文方法所采用的精细原子本征子空间投影阵列被证明是结构比较中一种有效的不变量。此外，推导出一种可视化的本征子空间投影函数（EPF），以自然表征原子周围的构型。一组完整的原子EPF构成了分子构象的内在表示，基于此可合理定义本征空间中的原子间EPF距离与分子间EPF距离。通过若干案例示例，分子间EPF距离在结构识别与比较中展现出非凡的合理性与高效性。
引用
@article{arxiv.1701.07917,
title = {Geometrical Eigen-subspace Framework Based Molecular Conformation Representation for Efficient Structure Recognition and Comparison},
author = {Xiao-Tian Li and Xiao-bao Yang and Yu-Jun Zhao},
journal= {arXiv preprint arXiv:1701.07917},
year = {2017}
}