利用答案集编程生成生物医学查询的解释
人工智能
2020-02-19 v1 计算机科学中的逻辑
摘要
我们引入了新的数学模型和算法，利用答案集编程（answer set programming）为生物医学查询生成（最短或 k 个不同的）解释。我们实现了这些算法并将其集成到 BIOQUERY-ASP 系统中。我们通过一些与药物发现相关的复杂生物医学查询，展示了这些方法在生物医学知识资源 PHARMGKB、DRUGBANK、BIOGRID、CTD、SIDER、DISEASE ONTOLOGY 和 ORPHADATA 上的实用性。本文即将发表于《逻辑编程的理论与实践》(Theory and Practice of Logic Programming, TPLP)。
引用
@article{arxiv.1309.6297,
title = {Generating Explanations for Biomedical Queries},
author = {Esra Erdem and Umut Oztok},
journal= {arXiv preprint arXiv:1309.6297},
year = {2020}
}
备注
42 pages, 14 figures, 4 tables, online appendix (proofs, 24 pages)