GCnet：基于格兰杰因果性探索与人脑中与智力障碍相关基因的动态因果关系
分子网络
2025-08-08 v1
摘要
智力障碍 (ID) 由智商低于 70 以及对两个以上适应行为缺陷定义。历史上，ID 患者常被社会边缘化，现代社会中仍面临显著苦难。ID 患案中可归因于遗传因素的比例存在差异。识别这些 ID 关联基因及其在脑发育过程中表达模式的因果关系，有助于我们更好地理解 ID 的分子基础。本文将在体外脑发育过程中收集的基因表达数据解释为时间序列，并进一步引入格兰杰因果检验来评估基因之间的动态依赖关系。这些评估用作构建基因表达网络和提取与 ID 相关的病理信息的输入，包括识别与疾病关键相关的新基因。为证明方法有效性，我们提供一份优先级列表，基于我们构建的格兰杰因果网络中 ZEB2 社区结构，识别出最可能与 Mowat Wilson 综合征相关的新基因 (Kutsche 等, 2018)。
引用
@article{arxiv.2508.05136,
title = {GCnet: Using Granger causality to explore the dynamic causality relations among genes as-sociated with intellectual disability in human brain},
author = {Lukas Madsen Brandt and Katja Nowick and Jing Qin},
journal= {arXiv preprint arXiv:2508.05136},
year = {2025}
}