从时间序列转录组学到基因调控网络:推断方法综述
分子网络
2022-11-03 v2
摘要
基因调控网络推断约20年来一直是活跃的研究领域,催生了基于多种假设与方法的复杂推断算法。随着对更精确且更强模型的需求不断增长,该推断问题仍具广泛科学兴趣。通过基因调控网络对生物系统进行抽象表示是研究此类系统的有力方法,其编码了不同量与类型的信息。本综述总结了专门基于时间序列转录组学的各类推断算法,并概述了基因调控网络在计算生物学中的主要应用。本综述旨在向生物学家与该课题新手研究者提供调控网络推断工具的更新概览,并指导其选择最契合自身问题、目标与实验数据的合适推断方法。
引用
@article{arxiv.2210.08542,
title = {From time-series transcriptomics to gene regulatory networks: a review on inference methods},
author = {Malvina Marku and Vera Pancaldi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2210.08542},
year = {2022}
}