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从双螺旋到B-DNA手性向列相:一个分子模型

生物物理 2009-11-10 v1 生物大分子

摘要

适当浓度的B-DNA溶液会形成左手手性向列相(胆甾相)。这种相也已在其他刚性或半柔性手性聚合物溶液中被观察到;胆甾相螺距的大小和手性与分子特征唯一相关。在这项工作中,我们提出了一种理论方法和数值程序,从聚电解质的结构出发,预测胆甾相螺距。基于聚合物之间的空间位阻和静电相互作用,获得了系统自由能的分子表达式;前者用排除体积描述,而后者采用平均场近似。计算针对130 bp的B-DNA片段进行。理论预测通过展示分子形状手性和电荷手性所起的对抗作用,为实验行为提供了解释。

关键词

引用

@article{arxiv.physics/0411203,
  title  = {From the double-stranded helix to the chiral nematic phase of B-DNA: a molecular model},
  author = {F. Tombolato and A. Ferrarini},
  journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0411203},
  year   = {2009}
}

备注

42 pages, 6 figures