患难之交:伴侣素如何识别并重塑需要折叠辅助的蛋白质
生物大分子
2022-11-29 v1
摘要
伴侣素是生物纳米机器,通过将被动力学捕获的错折叠态中解救出来,帮助新翻译的蛋白质折叠。在细菌蛋白质组中,一部分蛋白质的体内折叠辅助由伴侣素机器强制完成。伴侣素是大型寡聚复合物,具有异常的七重对称(I组)或八/九重对称(II组),形成双环结构,包围一个中央折叠腔。在ATP驱动循环中发生的剧烈大规模构象变化,使伴侣素能够结合错折叠蛋白质,将其封装入扩张的腔中,并释放回细胞环境,无论其是否折叠。与迭代退火机制相关的理论结合了蛋白质折叠的构象自由能景描述,\textit{定量}解释了大部分(即便不是全部)现有数据。错折叠构象对应于粗糙能量景中的低能极小值。这些低能构象的随机破坏导致更高自由能、折叠程度更低的构象,可随机分配进入天然态。I组伴侣素(真细菌及内共生细胞器中的GroEL同源物)非特异地识别大量错折叠蛋白质,并通过高度协调的协同运动运作。相比之下,了解较少的II组伴侣素(真核中的CCT,古菌中的thermosome/TF55)辅助特定的一组底物蛋白质。伴侣素与细菌感染、自身免疫疾病以及蛋白质聚集与降解疾病有关。理解伴侣素机制及其底物不仅对细胞蛋白质折叠的基础方面重要,也对有效治疗策略重要。
引用
@article{arxiv.2211.08623,
title = {Friends in need: how chaperonins recognize and remodel proteins that require folding assistance},
author = {George Stan and George H. Lorimer and D. Thirumalai},
journal= {arXiv preprint arXiv:2211.08623},
year = {2022}
}
备注
26 pages, 4 figures, to be published in Frontiers in Molecular Biosciences