非正交原子中心基组下随机密度泛函理论的核力
化学物理
2022-01-28 v2
摘要
我们发展了在线性标度随机密度泛函理论(sDFT)中于非正交原子中心基组表示(Fabian et al. WIREs Comput Mol Sci. 2019;e1412. https://doi.org/10.1002/wcms.1412)下计算核力的形式体系,并将其应用于溶于水的水溶性色氨酸拉链2(Trp-zip2)肽。我们采用嵌入片段方法以降低统计误差(涨落与系统偏差),其中整个肽为主片段,其余425个水分子被划分为小片段。我们分析了力中统计误差的大小,发现当使用120个随机轨道时,系统偏差量级为(),且与体系大小无关。该偏差量级足够小,可确保随机DFT(在朗之万分子动力学模拟中)估算的键长与确定性计算预测值的偏差小于1%。
引用
@article{arxiv.2108.06770,
title = {Forces from stochastic density functional theory under nonorthogonal atom-centered basis sets},
author = {Ben Shpiro and Marcel David Fabian and Eran Rabani and Roi Baer},
journal= {arXiv preprint arXiv:2108.06770},
year = {2022}
}
备注
18 pages, 5 figures