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非正交原子中心基组下随机密度泛函理论的核力

化学物理 2022-01-28 v2

摘要

我们发展了在线性标度随机密度泛函理论(sDFT)中于非正交原子中心基组表示(Fabian et al. WIREs Comput Mol Sci. 2019;e1412. https://doi.org/10.1002/wcms.1412)下计算核力的形式体系,并将其应用于溶于水的水溶性色氨酸拉链2(Trp-zip2)肽。我们采用嵌入片段方法以降低统计误差(涨落与系统偏差),其中整个肽为主片段,其余425个水分子被划分为小片段。我们分析了力中统计误差的大小,发现当使用120个随机轨道时,系统偏差量级为0.065eV/A˚0.065\,eV/\r{A}1.2×103Eh/a0\sim1.2\times10^{-3}E_{h}/a_{0}),且与体系大小无关。该偏差量级足够小,可确保随机DFT(在朗之万分子动力学模拟中)估算的键长与确定性计算预测值的偏差小于1%。

关键词

引用

@article{arxiv.2108.06770,
  title  = {Forces from stochastic density functional theory under nonorthogonal atom-centered basis sets},
  author = {Ben Shpiro and Marcel David Fabian and Eran Rabani and Roi Baer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2108.06770},
  year   = {2022}
}

备注

18 pages, 5 figures