FoodChem:一种食物-化学物质关系抽取模型
计算与语言
2021-10-11 v2 机器学习
摘要
本文提出 FoodChem,一种用于识别食物实体组成中存在化学物质的新关系抽取(Relation Extraction, RE)模型,基于生物医学同行评审科学文献提供的文本信息。该 RE 任务被视为二分类问题,旨在识别食物-化学物质实体对之间是否存在 contains 关系。这是通过微调 BERT、BioBERT 与 RoBERTa transformer 模型实现的。为评估,生成了一个带有食物-化学物质实体对 contains 关系标注的新数据集,包含 golden 与 silver 两个版本。这些模型被集成至投票方案中以生成数据集的 silver 版本,用于增强各独立模型,而人工标注的 golden 版本用于评估。在三个评估模型中,BioBERT 模型取得最佳结果,在非平衡增强设定下宏平均 F1 分数为 0.902。
引用
@article{arxiv.2110.02019,
title = {FoodChem: A food-chemical relation extraction model},
author = {Gjorgjina Cenikj and Barbara Koroušić Seljak and Tome Eftimov},
journal= {arXiv preprint arXiv:2110.02019},
year = {2021}
}
备注
8 pages, 3 figures, 2 tables