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有效再生数动态估计中的滤波与改进的不确定性量化

统计方法学 2020-12-04 v1 应用统计

摘要

有效再生数 RtR_t 衡量传染病的传播能力,即在一个再生时间内,在同时具有易感与非易感宿主的群体中产生的继发感染数。当前方法在估计 RtR_t 时未能正确量化不确定性,不符合 contagion 模式中观测变异性所预期的情况。我们通过对 Cori 等人(2013)的泊松抽样模型进行改进,详述了 RtR_t 的贝叶斯估计。通过添加自回归潜过程,我们在观测 RtR_t 的对数上构建了动态线性模型,从而得到滤波类型的贝叶斯推断。我们使用共轭分析,所有计算均为显式。结果显示对 RtR_t 估计的不确定性量化有所改进,该方法可靠,可被非专家安全使用并嵌入其他预测系统。我们用墨西哥当前 COVID19 流行的近期数据说明了我们的方法。

关键词

引用

@article{arxiv.2012.02168,
  title  = {Filtering and improved Uncertainty Quantification in the dynamic estimation of effective reproduction numbers},
  author = {Marcos A. Capistrán and Antonio Capella and J. Andrés Christen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2012.02168},
  year   = {2020}
}