从氨基酸极性需求的分子动力学计算看遗传密码的极端最优性
种群与进化
2008-04-01 v2 定量方法
摘要
本文提出了氨基酸极性需求的分子动力学计算，并将其用于对标准遗传密码进行评分。Monte Carlo 模拟表明，这种计算极性需求被标准遗传密码优化的程度超过了以往任何已知的度量。这些结果有力地支持了这样一种观点，即遗传密码是从现代核糖体生命之树根之前的一种生命群落状态演化而来的。
引用
@article{arxiv.0712.3332,
title = {Extreme genetic code optimality from a molecular dynamics calculation of amino acid polar requirement},
author = {Thomas Butler and Nigel Goldenfeld and Damien Mathew and Zaida Luthey-Schulten},
journal= {arXiv preprint arXiv:0712.3332},
year = {2008}
}
备注
4 pages, 2 figures. Revised manuscript describes signature of statistical proteins