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从临床笔记中抽取不良药物事件

计算与语言 2021-04-23 v1

摘要

不良药物事件(ADEs)是由药物或药物治疗引起的意外事件。为识别并抽取这些事件,我们不仅需要药物本身的信息,还需要描述药物的属性(如强度、剂量)、药物初始处方的原因,以及任何药物不良反应。本文利用关系抽取技术探索药物与其相关属性之间的关系。我们探索了三种方法:基于规则的方法、基于深度学习的方法,以及基于上下文语言模型的方法。我们在 n2c2-2018 ADE 抽取数据集上评估了我们的系统。实验结果表明,基于上下文语言模型的方法总体优于其他模型,并以 0.93 的精确率、0.96 的召回率和 0.94 的 F1F_1 分数在 ADE 抽取中取得了最先进的性能;然而,对于某些关系类型,基于规则的方法比任一学习方法获得了更高的精确率与召回率。

关键词

引用

@article{arxiv.2104.10791,
  title  = {Extracting Adverse Drug Events from Clinical Notes},
  author = {Darshini Mahendran and Bridget T. McInnes},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2104.10791},
  year   = {2021}
}

备注

9 pages, 4 figures