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探索用于药物发现的智能体系统的模块化

机器学习 2025-08-22 v2 计算与语言 多智能体系统

摘要

大型语言模型(LLM)和智能体系统为加速药物发现提供了令人兴奋的机会。在本研究中,我们考察了基于LLM的用于药物发现的智能体系统的模块化,即系统的各个部分(如LLM和智能体类型)是否可互换,这一主题在药物发现领域受到的关注有限。我们比较了不同LLM的性能以及工具调用智能体与代码生成智能体的有效性。我们的案例研究使用LLM作为评判者(LLM-as-a-judge)评分来比较在化学和药物发现中编排工具的性能,结果表明Claude-3.5-Sonnet、Claude-3.7-Sonnet和GPT-4o优于Llama-3.1-8B、Llama-3.1-70B、GPT-3.5-Turbo和Nova-Micro等替代语言模型。尽管我们确认代码生成智能体平均优于工具调用智能体,但我们表明这在很大程度上取决于具体问题和模型。此外,替换系统提示词的影响也取决于问题和模型,这强调即使在这个特定领域,也不能在不重新设计的情况下简单地替换系统组件。我们的研究强调了进一步研究智能体系统模块化的必要性,以便为现实世界的问题开发可靠且模块化的解决方案。

关键词

引用

@article{arxiv.2506.22189,
  title  = {Exploring Modularity of Agentic Systems for Drug Discovery},
  author = {Laura van Weesep and Samuel Genheden and Ola Engkvist and Jens Sjölund},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2506.22189},
  year   = {2025}
}